Il dottorato internazionale di architettura Villard d'Honnecourt è una struttura sperimentale che non ha precedenti in Europa nel campo delle discipline architettoniche. La sua specificità si basa: sulle modalità di funzionamento che si caratterizzano da un lato per l'itineranza di docenti e giovani ricercatori - intesa come strumento fondamentale di formazione, di integrazione e di scambi - e dall'altro con la massima apertura nei confronti di tutti i livelli delle istituzioni universitarie coinvolte; sulla monotematicità, come metodo per moltiplicare l'efficacia delle ricerche; sulla apertura disciplinare come occasione per riflettere sui cambiamenti che l'ambito dell'architettura ha conosciuto negli ultimi anni e per facilitare il confronto con le altre facoltà europee. È organizzato in cicli triennali monotematici. L'obiettivo del dottorato è formare ricercatori in architettura sui temi relativi alle specificità del territorio europeo e mediterraneo in rapporto alle trasformazioni contemporanee. L'organizzazione della didattica prevede un'articolazione in seminari itineranti nelle università coinvolte e periodi individuali di ricerca stanziale da svolgersi presso una delle università che compongono il panorama accademico del dottorato. La lingua ufficiale del dottorato è l'inglese.