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Le principal facteur qui affecte la population du Bruant (pinson) à queue aiguë est la perte d'habitat due aux activités humaines. Les parties les plus sèches des marais salés ou saumâtres se font fréquemment drainées pour faire place à l'agriculture. Des superficies importantes de marais ont ainsi été détruites. Le remplissage des marais pour la construction de résidences, de bâtiments commerciaux ou d'infrastructures routières ou portuaires sont d'autres exemples d'empiètement sur les marais. Toutefois, malgré ces pertes d'habitat, aucune contraction importante d'aire n'a été notée. Bien qu'il soit difficile d'évaluer la tendance de la population en raison de l'absence de données quantitatives réparties dans le temps, il semble qu'elle soit relativement stable. Dans l'ensemble de son aire, A.C. subvirgatus est relativement commun dans son habitat.